Prebiyotikler ise sindirim sistemi florasının bileşimini ve/veya aktivitesini etkileyerek konakçı sağlığı üzerinde olumlu etkileri olan, seçici olarak fermente edilebilen besin bileşenleri olarak tanımlanmaktadır.   Vücudumuza yararlı olan mikroorganizmaların beslenmesi için prebiyotikler gereklidir.   Sindirilmeden kolona ulaşan prebiyotikler, kolonda bulunan bakteriler tarafından fermantasyona uğrayarak hidrojen, metan, karbondioksit ve kısa zincirli yağ asitleri üretmektedir. Böylelikle bağırsağın pH’sını düşürerek ve  bağırsakta Bifidobacterium ve Lactobacillus gibi yararlı bakterilerin sayısını ve/veya aktivitesini artırarak insan sağlığı üzerine yararlı etkiler gösterebilmektedirler.